近年来，“重庆金佛山喀斯特生态系统国家野外科学观测研究站”立项的国家级和省部级项目60余项，其中承担了国家重点研发计划项目1项、专题10项，国家社科基金重大项目1项，国家自然科学基金重点项目1项、联合基金1项、人才项目1项、面上项目17项、青年基金12项，经费合计6216万元。

主要承担的科研项目有：